中新网甘肃新闻9月10日电 (李景潮)近日,由山东省林草种质资源中心和张掖市林业和草原局牵头开展的青檀古树基因组研究取得重要进展,完成千年青檀古树近端粒到端粒(Near‑completeT2T)高质量参考基因组组装解析,相关成果在国际期刊《Scientific Data》(中科院2区,影响因子7.2)发表。

青檀(Pteroceltis tatarinowii)是我国特有的单属单种孑遗濒危树种,隶属于大麻科青檀属;其韧皮纤维是传统宣纸的核心生产原料,具备重要的经济与文化价值。此前公开的青檀染色体水平基因组由于研究材料多采用幼龄扦插苗木,存在端粒、着丝粒等复杂基因组区域未能完整解析,古树长寿、强抗逆的独特遗传背景无法反映等短板。
山东省林草种质资源中心刘丹正高级工程师课题组,依托中央财政林业科技推广示范项目和国家林业和草原种质资源库运行服务项目,以千年青檀古树为材料,整合PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C多组学测序技术,开展近T2T水平基因组从头组装。组装得到千年青檀古树参考基因组大小689Mb,注释得到47 241个蛋白质编码基因,成功鉴定染色体上的端粒、着丝粒、rDNA等关键序列。该高质量基因组,为厘清青檀分类学争议、挖掘抗逆和纤维发育关键基因、制定古树种质科学保护策略提供重要基础遗传资源。
据了解,刘丹是中组部、团中央第26批博士服务团成员,山东省林草种质资源中心正高级工程师,现挂职张掖市林业和草原局党组成员、副局长。作为博士服务团选派干部,刘丹充分发挥专业优势,推动山东、甘肃两省在林草种质资源及古树名木保护领域协同创新,实现了东西部科研力量的优势互补。该研究由山东省林草种质资源中心/张掖市林业和草原局牵头,联合甘肃省祁连山水源涵养林研究院、河北科技师范学院、曲阜师范大学等单位共同完成。(完)
